具体做法如下：
方法一：(工程没有引用外部jar包时，直接导出)
选中工程---->右键，Export...--->Java--->JAR file--->next-->选择jar file的路径及名称-->next-->next---> 选择main class--->finish.
方法2：
当工程引用了其他的外部jar时，由于eclipse不支持同时导出外部jar包的功能，所以比较麻烦一点；具体步骤如下：
生成manifest file:选中工程--->右键，Export--->Java--->JAR file--->选择jar file的路径及名称--->next--->next--->next；
此时来到了方法1中要选择main class的窗口，但这里先不选择main class，选择最上方的Generate the manifest file, 勾上Save the manifest in the workspace,在Manifest file：中输入file的名称，如/testProject/main,（其中testProject为工程名,main为manifest file的名称）点击finish，回到工程，打开刚刚生成的main，在这里要输入如下信息：
Manifest-Version: 1.0
Main-Class: com.pacong.convert.auto.propertes.ConvertAutoProperties
Class-Path: jxl.jar
其中，Manifest-Version: 1.0为刚刚自动生成的manifest版本号；
Main-Class: com.pacong.convert.auto.propertes.ConvertAutoProperties为main class所在类；
Class-Path: jxl.jar为外部jar包名称，这里是告诉导出的jar包，所要用到的外部的jar包的路径及名称。
上面都做完了就可以导出带外部jar包的jar包了，步骤如下：
选中工程--->右键，Export--->Java--->JAR file--->选择jar file的路径及名称--->next--->next--->next，这时又来到了选择main class的窗口，但这里也不选择main class，选择Use existing manifest from workspace，在Manifest file:里选择刚刚生成的main,如：/testProject/main，点击finish，到此就大功告成啦；假设生成的jar包的名称为test.jar，那么Class-Path中引入的jxl.jar要和test.jar位于同一个目录下。
这里还有一点要注意：
如果想在命令行中运行刚刚生成的jar，命令如下：
java -jar test.jar
如果在jar中有一些System.out.prinln语句，运行后想看看打印出的内容，可以用一下命令：
java -jar test.jar >log.txt
输出信息会被打印到log.txt中，当然log.txt自动生成，并位于和test.jar一个目录中。
这里也可以新建一个start.bat文件，创建后；右键---编辑，输入:java -jar test.jar >log.txt；以后直接双击start.bat即可运行test.jar啦。
此部分来自CSDN博客，转载请标明出处：http://blog.csdn.net/kanfeikanfei/archive/2009/03/25/4024304.aspx
补充：
上面第二种方法对于含有较多第三方jar文件就显得不合适，太繁琐。这时可以使用一个打包的插件：fat jar。
附：图解Fat jar的使用
Fat Jar Eclipse Plug-In是一个可以将Eclipse Java Project的所有资源打包进一个可执行jar文件的小工具，可以方便的完成各种打包任务，我们经常会来打jar包，但是eclipse自带的打jar似乎不太够用，Fat Jar是eclipse的一个插件，特别是Fat Jar可以打成可执行Jar包，并且在图片等其他资源、引用外包方面使用起来更方便。
安装方法：
1. eclipse在线更新方法：
help >software updates >Search for new features to install>new update site>
填写name 和url
name：Fat Jar
url:http://kurucz-grafika.de/fatjar，这个是FatJarUpdateSite.
2. eclipse插件安装方法：
下载，地址在http://downloads.sourceforge.net/fjep/net.sf.fjep.fatjar_0.0.27.zip?modtime=1195824818&big_mirror=0，解压后将解压出的plugins中的文件复制到eclipse中的plugins目录下，然后重启eclipse，避免Fat Jar被认不出来，在eclipse启动时使用-clean参数。
使用方法(我用的eclipse是eclipse 3.3.2，Fat Jar是net.sf.fjep.fatjar_0.0.27)：
Fat Jar 打包插件，可以方便的完成各种打包任务，可以包含外部的包等 。呵呵！很好用...../，关于下载和安装就不说了，都很简单。怎么使用？、一开始我也搞了很久，网上说的都不是很详细，可以打包，但双击却运行不了。现在终于搞定了，就上来说一下。
开始：在你的工程项目里右键弹出下图：
然后Buile Fat Jar出现下图：
再然后就Next了，又出现下图：
MANIFEST.MF的用途(转载)
可以用的上的有：
1. Main-Class 指定程序的入口，这样可以直接用java -jar xxx.jar来运行程序。
2. Class-Path 指定jar包的依赖关系，class loader会依据这个路径来搜索class。
我平时用mf文件一般说来都是让jar成为可以直接运行这一目的。虽然目的这么简单，但是每次打包还是很容易出现各种各样的问题让人头痛。mf总是没有被应用，或者是出错了。
首先给出一个简单而标准的例子：
Manifest-Version: 1.0
Main-Class: ui.JFrameMain
Class-Path: jtds-1.2.jar c3p0-0.9.1.2.jar
esri_mo20.jar esri_mo20res.jar jsde83_sdk.jar
解释一下：
Manifest-Version mf文件版本号，这行照抄
Main-Class 包含main函数的类，程序的入口
Class-Path 用到的一些包
分析一下要点：
要点1：每行的“:”(冒号)用来分隔键值对。冒号后边一定要跟一个空格！！！
也就是说务必写为:
Main-Class:(空格)YouClassName
Class-Path:(空格)Class1.Jar
否则JBuilder会报("Manifest.mf": Error reading manifest: java.io.IOException: invalid header field
)这样的错。不再IDE帮助下做的JAR会发现MF没有起到应有的作用。顺便说一下以前我看到JBuilder报另一个个错大概说是什么换行符不对，好像也是由于这个问题引发的。原先总以为是windows里边的回车是由回车，换行2个字符构成而造成的。现在看来好像不是这样，是因为少了冒号后边那个空格。
要点2：Class-Path里边的内容用空格分隔而不是逗号或者分号。（唉。。。我总是下意识的用分号）
也就是说务必写成:
Class-Path:(空格)Class1.jar(空格)Class2.jar(空格)Class3.Jar
要点3:有的文章说MF文件每行不能超过七十多的字符，我的经验是如果在JBuilder里编辑MF超过了也无妨，一般我是尽量一行写完。续行挺麻烦又要以空格开头什么的。我也经常直接用winRar打开jar然后直接编辑里边的mf文件，这是个好方法，很直接了当，缺点就是如果改坏了也不会报错，只是MF有的部分失效了，好像运行时也会说"错误的MF文件版本"。
介绍几个技巧：
技巧1：使用winRar打开jar，双击MF文件，就可以编辑了，编辑完了Ctrl+S保存。特方便。也可以在外边写好一个Manifest.mf,然后直接拖入覆盖以前的。
技巧2：写一个run.bat来运行你的jar。run.bat大体内容如下：
java -jar yours.jar
pause
后边加一个pause就可以让你看到具体哪里出错了，一般来说问题如果出在MF上，那么往往就是哪个包，哪个类没有找到的NoClassDef这种异常。
https://blog.csdn.net/langgufu314/article/details/84623449
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